Calcule métricas de viés de uso de códons — RSCU, conteúdo GC3 e número efetivo de códons (ENC) — para qualquer sequência de codificação. Use esta ferramenta ao otimizar um gene para expressão heteróloga: genes hospedeiros altamente expressos normalmente usam um subconjunto preferido de códons, e combinar o uso de códons do seu gene com o pool de tRNA do hospedeiro pode melhorar drasticamente o rendimento da proteína. Valores baixos de ENC (aproximando-se de 20) indicam forte tendência para um subconjunto de códons, enquanto valores próximos a 61 sugerem uso relativamente uniforme entre códons sinônimos.

Métricas

• RSCU (uso relativo de códons sinônimos): relação entre a frequência observada e a frequência esperada
• Conteúdo GC3: conteúdo GC na terceira posição do códon
• ENC (Número Efetivo de Códons): Mede o viés de uso de códons (20 = viés extremo, 61 = sem viés)