Faça a varredura de todos os seis quadros de leitura de uma sequência de nucleotídeos para identificar quadros de leitura abertos delimitados por códons de início (ATG) e de parada, com filtragem de comprimento mínimo ajustável. Use esta ferramenta ao anotar um genoma recém-montado, validar um gene clonado ou procurar regiões codificadoras de proteínas potenciais em sequência não caracterizada. O mapa gráfico exibe as posições de ORF em todos os quadros, e ORFs mais longos são estatisticamente mais propensos a representar genes codificadores de proteínas genuínos - ORFs curtos abaixo de 100 códons são frequentemente falsos positivos de sequência aleatória.
Como funciona
- Verifica todos os 6 quadros de leitura (3 para frente, 3 para complemento reverso)
- Identifica ORFs do códon inicial (ATG) ao códon final (TAA/TAG/TGA)
- Filtro de comprimento ORF mínimo ajustável
- Cada ORF é traduzida em sua sequência proteica
- O mapa gráfico fornece uma visão geral das posições ORF
