Calcule estatísticas de sequência fundamentais, incluindo conteúdo de GC, distorção de GC, peso molecular, composição de base e coeficiente de extinção para qualquer sequência de DNA ou RNA. Use esta ferramenta ao caracterizar um gene recém-sequenciado, projetar ensaios qPCR onde o conteúdo de GC afeta a temperatura de recozimento ou relatar propriedades da sequência em uma publicação. O conteúdo de GC e os valores de distorção também fornecem pistas sobre regiões ricas em GC, origens de replicação e possíveis eventos de transferência horizontal de genes que podem ser relevantes para sua análise.
Recursos
- Conteúdo e inclinação do GC: porcentagem de GC e distorção (GC)/(G+C)
- Composição de base: contagens de nucleotídeos individuais e gráfico de rosca
- Peso molecular: PM estimado para ssDNA e dsDNA
- Coeficiente de extinção: Coeficiente de extinção molar aproximado
- Suporte FASTA: cole sequências com ou sem cabeçalhos FASTA