Pecah suatu barisan menjadi semua kemungkinan substring dengan panjang k dan hitung frekuensinya untuk mengungkap ciri komposisi barisan tersebut. Gunakan alat ini untuk menilai kualitas pengurutan, mendeteksi kontaminasi, atau membandingkan kumpulan genom — profil k-mer sangat berbeda antar spesies dan dapat mengungkap kesalahan sampel atau bias GC. Distribusi frekuensi mendekati Poisson yang mulus menunjukkan cakupan yang seragam, sementara puncak yang tidak terduga menunjukkan pengulangan, kontaminasi, atau pengurutan artefak yang harus diselidiki sebelum analisis lebih lanjut.

Tentang Analisis K-mer

K-mer adalah substring dengan panjang k dalam urutan biologis. Penghitungan K-mer sangat penting bagi banyak aplikasi bioinformatika termasuk perakitan genom, perbandingan urutan, dan metagenomik.