Pindai keenam kerangka pembacaan urutan nukleotida untuk mengidentifikasi kerangka pembacaan terbuka yang dibatasi oleh kodon start (ATG) dan stop, dengan pemfilteran panjang minimum yang dapat disesuaikan. Gunakan alat ini saat membuat anotasi pada genom yang baru dirakit, memvalidasi gen yang dikloning, atau mencari daerah pengkode protein potensial dalam urutan yang tidak dikarakterisasi. Peta grafis menampilkan posisi ORF di semua bingkai, dan ORF yang lebih panjang secara statistik lebih mungkin mewakili gen pengkode protein asli — ORF pendek di bawah 100 kodon sering kali merupakan hasil positif palsu dari urutan acak.

Cara Kerjanya

• Memindai semua 6 bingkai bacaan (3 maju, 3 komplemen mundur)
• Mengidentifikasi ORF dari kodon awal (ATG) hingga kodon stop (TAA/TAG/TGA)
• Filter panjang ORF minimum yang dapat disesuaikan
• Setiap ORF diterjemahkan ke urutan proteinnya
• Peta grafis memberikan gambaran visual posisi ORF