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Análise de Northern Blot

O Northern Blotting é uma técnica laboratorial usada para detectar e quantificar moléculas específicas de RNA dentro de uma amostra biológica. Enquanto um Western blot analisa proteínas e um Southern blot analisa DNA, o Northern blot informa aos cientistas quais genes estão realmente “ligados” (expressos) em uma célula em um momento específico. Medindo a quantidade de RNA mensageiro (mRNA), os pesquisadores podem determinar se uma doença, um medicamento ou uma mudança ambiental está fazendo uma célula aumentar ou diminuir a produção de instruções específicas.

Como Funciona o Northern Blotting

Diagrama da análise de Northern blot.

O RNA é notoriamente frágil e propenso a ser degradado por enzimas chamadas RNases que estão em toda parte — até mesmo em seus dedos. Por causa disso, o processo requer extremo cuidado e condições “limpas”.

  1. Separação do RNA

O RNA total é extraído das células e separado por tamanho usando eletroforese em gel. Como o RNA é de fita simples, ele tende a se dobrar em formas complexas; para evitar isso, um agente “desnaturante” (como formaldeído) é adicionado ao gel para manter as moléculas de RNA lineares, de modo que se movam estritamente de acordo com seu comprimento.

  1. Transferência

Assim como em um Western blot, as fitas de RNA separadas são transferidas do gel frágil para uma membrana resistente de nylon ou nitrocelulose. Isso é frequentemente feito por ação capilar, onde uma pilha de papel toalha “absorve” o tampão SSC (solução salina-citrato de sódio) através do gel e da membrana, puxando o RNA junto e prendendo-o na superfície da membrana.

  1. Hibridização

A membrana é exposta a uma sonda — um pequeno pedaço de DNA ou RNA de fita simples que é complementar à sequência alvo. Esta sonda é “marcada” com um átomo radioativo ou um corante fluorescente. A sonda varre a membrana e se liga (hibridiza) apenas ao seu parceiro de RNA correspondente, ignorando todo o resto do RNA “ruído”.

  1. Detecção

Após lavar as sondas não ligadas, a membrana é colocada contra um filme de raio-X ou escaneada com um imageador digital. As sondas marcadas criam bandas escuras ou linhas brilhantes. A espessura e intensidade da banda informam ao cientista exatamente quanto daquele mRNA específico estava presente na amostra original.