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Análise de Southern Blot

O Southern Blotting é uma técnica laboratorial usada para detectar uma sequência específica de DNA dentro de uma amostra genômica complexa. Nomeado em homenagem ao seu inventor, Edwin Southern, este método permite que os cientistas identifiquem uma única “frase” de informação genética de uma biblioteca contendo milhões de palavras. É o padrão ouro para verificar inserções gênicas, identificar mutações genéticas e foi a base original para a “impressão digital de DNA” na ciência forense.

Como Funciona o Southern Blotting

Diagrama da análise de Southern blot.

Como um genoma é tão massivo, você não pode simplesmente colocá-lo em um gel e esperar ver genes individuais; pareceria apenas um borrão contínuo. O Southern blotting usa corte preciso e sondas do tipo “velcro” para encontrar o alvo.

  1. Digestão

O DNA extraído é tratado com enzimas de restrição. Estas tesouras moleculares cortam o DNA apenas em sequências específicas, dividindo as longas fitas genômicas em milhares de fragmentos menores de comprimentos variados.

  1. Eletroforese

Os fragmentos de DNA são separados por tamanho usando um gel de agarose. Fragmentos pequenos movem-se rapidamente através do gel, enquanto os grandes permanecem próximos ao topo. Para tornar o DNA “pegajoso” para o próximo passo, o gel é tratado com uma solução alcalina para desnaturar o DNA de fita dupla em fitas simples.

  1. Transferência

O DNA é transferido do gel frágil para uma membrana resistente de nylon ou nitrocelulose. Isso é tipicamente feito através de ação capilar: uma pilha de papel toalha seco puxa o tampão SSC (solução salina-citrato de sódio) para cima através do gel e da membrana. À medida que o líquido se move, ele carrega o DNA para fora do gel e o prende permanentemente na superfície da membrana.

  1. Hibridização e Detecção

A membrana é incubada com uma sonda de DNA marcada — um pequeno fragmento de DNA de fita simples que é a imagem espelho exata da sequência alvo. A sonda “caça” através da membrana até encontrar sua correspondência e se prender a ela (hibridização). Após lavar a sonda extra, a membrana é exposta a um filme de raio-X ou a um escâner digital para revelar a localização exata e o tamanho do gene alvo.