Berechnen Sie grundlegende Sequenzstatistiken, einschließlich GC-Gehalt, GC-Skew, Molekulargewicht, Basenzusammensetzung und Extinktionskoeffizienten für jede DNA- oder RNA-Sequenz. Verwenden Sie dieses Tool, wenn Sie ein neu sequenziertes Gen charakterisieren, qPCR-Assays entwerfen, bei denen der GC-Gehalt die Annealing-Temperatur beeinflusst, oder Sequenzeigenschaften in einer Veröffentlichung melden. GC-Gehalt und Skew-Werte liefern außerdem Hinweise auf GC-reiche Regionen, Replikationsursprünge und potenzielle horizontale Gentransferereignisse, die für Ihre Analyse relevant sein können.
Funktionen
- GC-Gehalt und Skew: GC-Prozentsatz und (G-C)/(G+C)-Skew
- Basenzusammensetzung: Individuelle Nukleotidzahlen und Donut-Diagramm
- Molekulargewicht: Geschätztes MW für ssDNA und dsDNA
- Extinktionskoeffizient: Ungefährer molarer Extinktionskoeffizient
- FASTA-Unterstützung: Sequenzen mit oder ohne FASTA-Header einfügen