Calcule las métricas de sesgo de uso de codones (RSCU, contenido de GC3 y número efectivo de codones (ENC)) para cualquier secuencia de codificación. Utilice esta herramienta cuando optimice un gen para la expresión heteróloga: los genes del huésped altamente expresados generalmente usan un subconjunto preferido de codones, y hacer coincidir el uso de codones de su gen con el conjunto de ARNt del huésped puede mejorar drásticamente el rendimiento de proteínas. Los valores bajos de ENC (cercanos a 20) indican un fuerte sesgo hacia un subconjunto de codones, mientras que los valores cercanos a 61 sugieren un uso relativamente uniforme entre codones sinónimos.

Métricas

• RSCU (Uso relativo de codones sinónimos): Relación entre la frecuencia observada y la esperada
• Contenido de GC3: contenido de GC en la posición del tercer codón
• ENC (Número efectivo de codones): Mide el sesgo de uso de codones (20 = sesgo extremo, 61 = sin sesgo)