Escanee los seis marcos de lectura de una secuencia de nucleótidos para identificar marcos de lectura abiertos delimitados por codones de inicio (ATG) y parada, con filtrado de longitud mínima ajustable. Utilice esta herramienta al anotar un genoma recién ensamblado, validar un gen clonado o buscar posibles regiones codificadoras de proteínas en una secuencia no caracterizada. El mapa gráfico muestra las posiciones de los ORF en todos los fotogramas, y los ORF más largos tienen estadísticamente más probabilidades de representar genes codificadores de proteínas genuinos; los ORF cortos por debajo de 100 codones suelen ser falsos positivos de una secuencia aleatoria.

Cómo funciona

• Escanea los 6 marcos de lectura (3 hacia adelante, 3 hacia atrás en complemento)
• Identifica ORF desde el codón de inicio (ATG) hasta el codón de parada (TAA/TAG/TGA)
• Filtro de longitud ORF mínima ajustable
• Cada ORF se traduce a su secuencia de proteínas.
• El mapa gráfico proporciona una descripción visual de las posiciones ORF