Calculez les propriétés physicochimiques clés d’une séquence protéique, notamment le poids moléculaire, le pI théorique, la charge nette à un pH donné, le score d’hydropathie GRAVY, le coefficient d’extinction et l’indice d’instabilité. Utilisez cet outil lors de la caractérisation d’une protéine recombinante : le pI guide le choix du tampon pour la chromatographie échangeuse d’ions, et le score GRAVY prédit la solubilité et l’association membranaire. L’indice d’instabilité permet d’évaluer si la protéine est susceptible de rester stable en solution pendant la purification et les applications en aval.
Propriétés calculées
- Poids moléculaire : Somme des masses de résidus d’acides aminés + eau
- pI théorique : point isoélectrique à partir des valeurs pKa du groupe ionisable
- Charge au pH : Charge nette selon l’équation de Henderson-Hasselbalch
- GRAVY Score : Grande moyenne d’hydropathie (Kyte-Doolittle)
- Coefficient d’extinction : Absorptivité molaire à 280 nm
- Indice d’instabilité : prédit la stabilité des protéines in vitro