Calculez les statistiques de séquence fondamentales, notamment le contenu GC, l’asymétrie GC, le poids moléculaire, la composition en bases et le coefficient d’extinction pour toute séquence d’ADN ou d’ARN. Utilisez cet outil pour caractériser un gène nouvellement séquencé, concevoir des tests qPCR dans lesquels le contenu GC affecte la température d’hybridation ou rapporter les propriétés de la séquence dans une publication. Le contenu GC et les valeurs asymétriques fournissent également des indices sur les régions riches en GC, les origines de réplication et les événements potentiels de transfert de gènes horizontal qui peuvent être pertinents pour votre analyse.
Fonctionnalités
- Contenu GC et biais : pourcentage GC et biais (G-C)/(G+C)
- Composition de la base : nombre de nucléotides individuels et graphique en anneau
- Poids moléculaire : MW estimé pour l’ADNsb et l’ADNdb
- Coefficient d’extinction : Coefficient d’extinction molaire approximatif
- Support FASTA : Coller des séquences avec ou sans en-têtes FASTA