Virus adalah parasit intraseluler obligat yang terdiri dari materi genetik (DNA atau RNA) yang terbungkus dalam kapsid protein, kadang-kadang dikelilingi oleh amplop lipid. Mereka tidak dianggap sebagai organisme hidup karena mereka tidak dapat bereplikasi atau melakukan proses metabolik di luar sel inang.
Struktur Dasar Virus
Genom virus dapat berupa DNA atau RNA, untai tunggal atau ganda, linier atau sirkular, dan tersegmentasi atau tidak tersegmentasi; genom virus secara signifikan lebih kecil dari genom seluler, biasanya 3-200 kb. Kapsid adalah cangkang protein yang terdiri dari subunit berulang yang disebut kapsomer yang melindungi genom virus, dan kapsid menunjukkan simetri ikosahedral, heliks, atau kompleks. Amplop adalah bilayer lipid yang berasal dari membran sel inang, dihiasi dengan glikoprotein virus (duri) yang memediasi perlekatan dan masuknya sel inang. Protein matriks ditemukan pada virus beramplop antara kapsid dan amplop, memberikan integritas struktural.
Simetri Kapsid
Simetri ikosahedral memiliki dua puluh permukaan segitiga yang membentuk cangkang bulat, seperti yang terlihat pada adenovirus, herpesvirus, dan poliovirus, dengan jumlah kapsomer yang bervariasi (misalnya 252 pada adenovirus). Simetri heliks memiliki kapsomer yang tersusun dalam heliks di sekitar genom, membentuk struktur seperti batang atau filamentosa, seperti yang terlihat pada tobacco mosaic virus, virus rabies, dan virus Ebola. Simetri kompleks menggambarkan virus seperti poxvirus dan bakteriofag yang tidak sesuai dengan simetri ikosahedral atau heliks sederhana, sering mengandung struktur khusus seperti ekor dan serat.
Klasifikasi berdasarkan Jenis Genom
Klasifikasi Baltimore membagi virus menjadi tujuh kelompok berdasarkan jenis genom dan strategi replikasi. Grup I terdiri dari virus dsDNA (misalnya adenovirus, herpesvirus); Grup II terdiri dari virus ssDNA (misalnya parvovirus); Grup III terdiri dari virus dsRNA (misalnya reovirus); Grup IV terdiri dari virus ssRNA indra positif (misalnya coronavirus, poliovirus); Grup V terdiri dari virus ssRNA indra negatif (misalnya influenza, rabies); Grup VI terdiri dari retrovirus ssRNA-RT (misalnya HIV); dan Grup VII terdiri dari virus dsDNA-RT (misalnya virus hepatitis B).
Klasifikasi Taksonomi
Dalam taksonomi virus, ordo adalah peringkat taksonomi tertinggi (misalnya Mononegavirales, Herpesvirales). Nama famili berakhiran -viridae (misalnya Picornaviridae, Coronaviridae, Retroviridae). Nama genus berakhiran -virus (misalnya Enterovirus, Betacoronavirus, Lentivirus). Spesies didefinisikan sebagai kelompok virus monofiletik dengan sifat biologis dan genomik yang sama.
Morfologi Virus
Virus telanjang (tanpa amplop) memiliki kapsid yang langsung terpapar, membuatnya resisten terhadap kekeringan, asam, dan deterjen, dan biasanya ditularkan melalui rute fekal-oral dan fomites. Virus beramplop lebih sensitif terhadap kondisi lingkungan, panas, dan disinfektan, dan biasanya ditularkan melalui kontak langsung, darah, atau droplet pernapasan.
