L’enrobage crée un bloc de paraffine qui maintient le spécimen tissulaire dans une orientation spécifique pour la coupe au microtome. La biobanque étend la gestion des blocs à la conservation à long terme pour la recherche et la médecine personnalisée.
Enrobage
L’enrobeuse délivre de la paraffine fondue (55-60°C) dans un moule de taille appropriée. La cassette contenant le tissu traité est placée sur le moule et de la paraffine supplémentaire est délivrée. Le technicien oriente soigneusement le spécimen pour garantir que la surface de coupe histologiquement pertinente soit orientée vers le bas, contre le fond du moule. Une orientation incorrecte donne des coupes qui manquent la zone diagnostique. Le bloc refroidit sur une plaque froide (-5°C à 0°C) jusqu’à durcissement (5-15 minutes selon la taille), puis le moule est retiré, laissant la cassette attachée au bloc. Le bord du moule est nettoyé pour retirer l’excès de paraffine.
Défis d’Enrobage
Tissu adipeux / sein — la faible densité du tissu adipeux le rend flottant dans la paraffine fondue et difficile à orienter ; les gros spécimens adipeux retiennent des poches d’air. Un temps de déshydratation prolongé, des étapes d’éclaircissement multiples et un séchage sous vide aident. Les spécimens de petite taille (biopsies, microbiopsies, microbiopsies) nécessitent des techniques spéciales : les enrobages de précipitation à l’agarose ou à l’histogel immobilisent le spécimen dans un gel qui facilite l’orientation et empêche la perte de fragments. Tissu multilobulaire ou fibreux — l’infiltration par la paraffine est défiante ; les spécimens fibreux (cœur, utérus, cicatrices) peuvent être coupés en tranches plus fines avant traitement.
Contrôle Qualité de l’Enrobage
Chaque bloc doit être inspecté : le tissu est-il complètement infiltré sans zones blanches (paraffine non infiltrée) ? L’orientation est-elle correcte ? Le bloc contient-il des bulles d’air ou des fissures ? Le bloc est-il exempt de débris de coupe de cassettes précédentes (contamination croisée) ? Les moules d’enrobage doivent être de taille appropriée — trop grands et la paraffine se rétracte en formant une surface inégale ; trop petits et le tissu est comprimé.
Biobanque
La biobanque fait référence à la collecte, au traitement, au stockage et à la distribution systématiques d’échantillons biologiques (tissus, sang, ADN) accompagnés de données cliniques et de suivi associées. Les biobanques hospitalières stockent des blocs de paraffine et des lames en tant que matériel résiduel de diagnostic, mais collectent également du tissu congelé frais et du sang/plasma/sérum appariés. Le bloc de paraffine est l’épine dorsale de la biobanque anatomopathologique — il est stable indéfiniment à température ambiante, permet des coupes récurrentes pour l’IHC et la biologie moléculaire, et constitue une archive de l’ensemble du spécimen diagnostique. La congélation rapide de l’échantillon dans l’isopentane refroidi à l’azote liquide préserve l’ARN, l’ADN et les protéines en limitant l’activité enzymatique ; les blocs congelés sont stockés à -80°C et épuisables (chaque coupe détruit du tissu).
Traceabilité et Gestion
Chaque bloc doit avoir un identifiant unique (numéro de pathologie, numéro de cassette ré-écrit manuellement, ou code-barres). L’emplacement de stockage — rangée, colonne, armoire, bâtiment — doit être documenté. Le logiciel de gestion (LIMS — Laboratory Information Management System) suit les prêts, les coupes récurrentes, le transfert vers d’autres laboratoires et la destruction. La biobanque nécessite un consentement éclairé pour l’utilisation du matériel résiduel ainsi qu’une gouvernance pour l’accès aux échantillons et aux données. Les normes ISO 20387 et les recommandations de l’OCDE encadrent les bonnes pratiques de biobanque.
Garantie de Qualité
La qualité de la biobanque est évaluée par la pureté de l’échantillon (pourcentage de cellules tumorales vérifié sur H&E), la viabilité (pour les échantillons congelés, la qualité de l’ARN déterminée par la valeur RIN), l’intégrité du temps d’ischémie (temps entre le clampage vasculaire et la congélation) et l’exhaustivité des données cliniques associées. Les processus de contrôle qualité — relecture H&E de chaque bloc avant insertion en biobanque, notation du pourcentage de cellules tumorales et de nécrose — garantissent que les échantillons fournis aux chercheurs sont adaptés à l’objectif recherché.
