Análise de Uso de Códons: Decodificando Preferências de Tradução
A análise de uso de códons examina a frequência de códons sinônimos para estudar eficiência de tradução, expressão gênica e adaptação evolutiva.
Modelos Ocultos de Markov na Análise de Sequências
Modelos ocultos de Markov são estruturas probabilísticas para modelar padrões de sequência na descoberta de genes, alinhamento e classificação de famílias proteicas.
Análise de K-mer: Composição e Frequência de Sequências
A análise de k-mer conta substrings curtas de comprimento k em sequências para caracterização de genomas, correção de erros e agrupamento metagenômico.
Descoberta de Motivos: Encontrando Padrões Reguladores em Sequências
A descoberta de motivos identifica padrões de sequência curtos e conservados que representam sítios de ligação ou elementos funcionais.
Alinhamento Múltiplo de Sequências: Comparando Três ou Mais Sequências
O alinhamento múltiplo de sequências estende o alinhamento pareado para comparar múltiplas sequências homólogas para análise filogenética e funcional.
Desenho de Primers para PCR e Sequenciamento
O desenho de primers cria oligonucleotídeos curtos com termodinâmica e especificidade ideais para amplificação por PCR e reações de sequenciamento.
Análise de Promotores: Identificando Regiões Reguladoras
A análise de promotores identifica sítios de início de transcrição e elementos reguladores que controlam a expressão gênica.
Alinhamento de Sequências: Comparação Pareada de Sequências Biológicas
O alinhamento de sequências organiza sequências de DNA, RNA ou proteínas para identificar regiões de similaridade e relações evolutivas.
Montagem de Sequências: Reconstruindo DNA a Partir de Fragmentos
Algoritmos de montagem de sequências mesclam fragmentos de DNA sobrepostos em sequências contíguas para reconstrução de genomas e transcriptomas.
