淀粉样蛋白、色素和矿物沉积物在多种疾病中积累在组织中。它们的组织化学鉴定提供了通常无法通过任何其他技术做出的特异性诊断。

刚果红用于淀粉样蛋白

刚果红是淀粉样蛋白的标准组织化学染色。在碱性溶液中，刚果红通过插入相邻β链之间与淀粉样原纤维的β-折叠片结构结合。在明视野显微镜下，淀粉样沉积物染成鲑鱼粉色至红色。诊断性发现是交叉偏振器下的苹果绿色双折射——刚果红分子沿淀粉样原纤维排列的结果，而淀粉样原纤维本身排列成高度有序的双折射阵列。

淀粉样蛋白类型（AL、AA、ATTR、Aβ等）不能仅通过刚果红区分——需要淀粉样蛋白亚型的IHC（κ和λ轻链、血清淀粉样蛋白A、转甲状腺素蛋白、β-淀粉样蛋白）或质谱分析进行分型。刚果红对大沉积物敏感性高，但可能遗漏早期或小的沉积物——在偏振光下检查多个切片。刚果红假阳性结合可能发生在弹性纤维、胶原和透明质中——只有苹果绿色双折射才能确认淀粉样蛋白。

硫黄素T

硫黄素T是一种荧光染料，与淀粉样蛋白结合并显示增强的荧光，具有特征性的发射偏移。它比刚果红更敏感，用于检测小的淀粉样沉积物，但需要荧光显微镜且特异性较差。刚果红仍然是淀粉样蛋白诊断的金标准。

Perls普鲁士蓝用于铁

Perls普鲁士蓝检测组织切片中的三价铁（Fe3+）。切片用盐酸和亚铁氰化钾处理；铁离子与亚铁氰化物反应形成不溶的普鲁士蓝（亚铁氰化铁）。反应在铁的位置产生蓝色沉淀。背景通常用核固红复染。

Perls染色可识别铁过载情况下的含铁血黄素（聚集的铁蛋白）：遗传性血色病（肝细胞铁）、输血相关性铁沉着、酒精性肝病和溶血性贫血。在骨髓中，Perls对可染铁进行分级（0-6级）。在肺中，Perls显示心力衰竭细胞（含铁血黄素巨噬细胞）见于肺淤血，并确认肺含铁血黄素沉着症。在脾和淋巴结中，出血或梗死后的铁沉积易于识别。

Von Kossa用于钙

Von Kossa染色通过用银离子替换不溶性钙盐（磷酸盐、碳酸盐）中的钙来检测钙沉积。在紫外光或强光下，银被还原为金属银，呈现黑色或棕色。背景用核固红或van Gieson复染。

Von Kossa用于显示病理性钙化：坏死组织中的营养不良性钙化、肿瘤中的钙化（脑膜瘤、甲状腺乳头状癌、卵巢浆液性癌中的砂粒体）、钙化心脏瓣膜和钙化性肌腱炎。它还识别转移性钙化（由于高钙血症在正常组织中的钙沉积）见于肾、肺和胃粘膜。Von Kossa不检测草酸钙——对于草酸盐，使用pH 4.0的茜素红S或偏振光（草酸盐晶体具有双折射性）。

茜素红S用于钙

茜素红S在碱性pH（4.0-4.5）下与钙离子形成橙红色沉淀。它比Von Kossa对钙更特异，检测磷酸钙和草酸钙。茜素红用于识别软组织中的钙沉积、血管钙化和肾钙质沉着症。它也是识别骨和牙齿组织学切片中钙的标准染色。

胆红素和胆汁染色

Fouchet染色（三氯乙酸和氯化铁）将胆红素氧化为绿色的胆绿素，然后呈绿色/蓝色至翡翠绿色的胆汁。用于识别肝活检中的肝内和肝外胆汁淤积以及小管中的胆汁血栓。Hall染色（Van Gieson加Fouchet）同时染色胆汁（绿色/蓝色）和胶原（红色）。胆汁色素必须与脂褐素（衰老色素）和含铁血黄素区分——Perls将铁染成蓝色，PAS可变地染色脂褐素。

黑色素漂白

黑色素是一种内源性棕黑色色素，可能掩盖细胞细节和IHC解读。黑色素漂白（高锰酸钾随后草酸）在不损害组织形态或抗原性的情况下去除黑色素，允许评估深黑色素沉积下的细胞细节。漂白切片可在方案优化后用于IHC。

质量控制

每种特殊染色需要同时运行适当的阳性对照：含淀粉样蛋白的组织（刚果红）、铁过载肝脏（Perls）、钙化动脉（Von Kossa）和胆汁染色的肝脏（Fouchet）。对照失败使该批运行无效。标准故障排除程序适用——如果对照弱，检查试剂新鲜度、pH和孵育时间。