可变剪接分析识别和定量同一基因产生的不同 mRNA 异构体。
差异表达分析识别在不同条件间表达变化具有统计学显著性的基因。
微阵列数据分析处理探针强度，同时测量数千个基因的表达。
RNA-seq 利用高通量测序定量转录本丰度并发现新型 RNA 物种。
单细胞 RNA-seq 在单个细胞水平上分析基因表达谱，揭示细胞异质性。
小 RNA 测序捕获在转录后水平调控基因表达的 miRNAs、siRNAs 和 piRNAs。
转录组组装在没有参考基因组的情况下从 RNA-seq 读段重建全长转录本序列。
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