Bioinformatique de la protéomique : analyse des données protéiques
La bioinformatique de la protéomique développe des méthodes computationnelles pour identifier, quantifier et caractériser les protéines à partir de données de spectrométrie de masse.
ProtéomiqueProtéomique quantitative : mesure de l'abondance des protéines
La protéomique quantitative utilise des stratégies de marquage et des méthodes sans marquage pour mesurer les abondances relatives ou absolues des protéines.
ProtéomiqueProtéomique ciblée : méthodes SRM et MRM
La protéomique ciblée utilise la surveillance de réaction sélectionnée pour quantifier des protéines spécifiques avec une haute sensibilité et reproductibilité.
ProtéomiqueProtéomique top-down : analyse des protéines intactes
La protéomique top-down analyse les protéines intactes sans digestion, préservant les informations sur les protéiformes et les modifications post-traductionnelles.
ProtéomiqueAnalyse de l'usage des codons : décoder les préférences de traduction
L'analyse de l'usage des codons examine la fréquence des codons synonymes pour étudier l'efficacité de la traduction, l'expression génique et l'adaptation évolutive.
Analyse de séquencesModèles de Markov cachés dans l'analyse de séquences
Les modèles de Markov cachés sont des cadres probabilistes pour modéliser les motifs de séquence dans la recherche de gènes, l'alignement et la classification des familles de protéines.
Analyse de séquencesAnalyse des k-mers : composition et fréquence des séquences
L'analyse des k-mers compte les sous-chaînes courtes de longueur k dans les séquences pour la caractérisation des génomes, la correction d'erreurs et le regroupement métagénomique.
Analyse de séquencesDécouverte de motifs : trouver des motifs régulateurs dans les séquences
La découverte de motifs identifie des motifs de séquence courts et conservés qui représentent des sites de liaison ou des éléments fonctionnels.
Analyse de séquencesAlignement de séquences multiples : comparer trois séquences ou plus
L'alignement de séquences multiples étend l'alignement par paires pour comparer plusieurs séquences homologues en vue d'analyses phylogénétiques et fonctionnelles.
Analyse de séquences