Emerging virus patogen adalah virus yang baru muncul dalam suatu populasi atau yang kejadian atau jangkauan geografisnya berkembang pesat. Selama beberapa dekade terakhir, frekuensi kemunculan penyakit menular telah meningkat secara dramatis, didorong oleh gangguan ekologi, perubahan iklim, perjalanan global, dan intensifikasi produksi peternakan. Memahami faktor-faktor yang mendorong munculnya virus sangat penting untuk kesiapsiagaan dan pencegahan pandemi.

Pendorong Munculnya Virus

Munculnya patogen virus baru didorong oleh interaksi kompleks antara faktor ekologi, lingkungan, dan antropogenik. Perubahan penggunaan lahan, termasuk penggundulan hutan, perluasan pertanian, dan urbanisasi, meningkatkan kontak manusia dengan reservoir satwa liar dan virus-virusnya, sehingga mengganggu hambatan ekologi yang secara historis membatasi penyebarannya. Perubahan iklim mengubah distribusi geografis virus yang ditularkan melalui vektor seperti demam berdarah, chikungunya, dan Zika, memperluas jangkauan virus ke wilayah yang sebelumnya beriklim sedang karena vektor nyamuk (Aedes aegypti dan Aedes albopictus) memperluas habitatnya. Perdagangan satwa liar dan perburuan daging hewan liar menciptakan jalur langsung penularan patogen dari hewan ke manusia. Perjalanan udara global memungkinkan orang yang terinfeksi untuk melakukan perjalanan dari desa terpencil ke kota besar dalam waktu kurang dari 24 jam, sehingga memfasilitasi penyebaran internasional yang cepat, seperti yang ditunjukkan oleh epidemi Ebola di Afrika Barat pada tahun 2014-2016 dan pandemi COVID-19. Intensifikasi produksi ternak, khususnya konsentrasi hewan yang seragam secara genetis di fasilitas terbatas, menciptakan kondisi untuk amplifikasi patogen dan munculnya strain baru.

Limpahan Zoonosis dan Konsep One Health

Sebagian besar penyakit menular yang muncul bersifat zoonosis, berasal dari reservoir hewan sebelum melewati batas spesies untuk menginfeksi manusia. Proses limpahan melibatkan serangkaian langkah: patogen harus ada di inang reservoir, dilepaskan dalam jumlah yang cukup, bertahan hidup di lingkungan, menghubungi manusia yang rentan, dan berhasil menimbulkan infeksi. Setiap langkah dipengaruhi oleh faktor ekologi, perilaku, dan imunologi yang menentukan kemungkinan kemunculannya. Pendekatan One Health mengakui bahwa kesehatan manusia, kesehatan hewan, dan kesehatan lingkungan saling berhubungan dan mendukung upaya kolaboratif dan lintas disiplin untuk memantau dan mengendalikan penyakit menular yang muncul pada antarmuka manusia-hewan-lingkungan. Surveilans terhadap satwa liar dan ternak untuk mencari virus baru yang berpotensi menjadi pandemi, dikombinasikan dengan penilaian risiko berdasarkan ciri-ciri virus seperti pengikatan reseptor, kapasitas replikasi, dan penghindaran kekebalan, memungkinkan peringatan dini dan respons cepat.

Virus Corona

Virus corona adalah virus RNA indera positif yang diselimuti dengan genom RNA terbesar yang diketahui (kira-kira 30 kb) yang telah menyebabkan tiga wabah besar dalam dua dekade terakhir: sindrom pernafasan akut parah (SARS-CoV) pada tahun 2002–2003, sindrom pernapasan Timur Tengah (MERS-CoV) sejak tahun 2012, dan SARS-CoV-2 yang menyebabkan pandemi COVID-19 yang dimulai pada tahun 2019. Virus corona menginfeksi berbagai hewan inang termasuk kelelawar, yang kemungkinan merupakan reservoir nenek moyang SARS-CoV dan SARS-CoV-2, sering kali melalui inang perantara seperti musang (SARS-CoV) atau trenggiling (SARS-CoV-2). Protein lonjakan virus corona, yang bertanggung jawab atas pengikatan reseptor dan fusi membran, merupakan penentu utama jangkauan inang dan tropisme jaringan. SARS-CoV-2 menggunakan enzim pengonversi angiotensin 2 (ACE2) sebagai reseptor masuknya, dengan domain pengikat reseptor protein lonjakan (RBD) yang mengikat ACE2 dengan afinitas tinggi. Munculnya varian SARS-CoV-2 yang menjadi perhatian, termasuk Alpha, Beta, Gamma, Delta, dan Omicron, telah menunjukkan kemampuan virus RNA untuk berevolusi dengan cepat pada manusia, memperoleh mutasi yang meningkatkan penularan, penghindaran antibodi, dan dalam beberapa kasus, mengubah tingkat keparahan penyakit.

Filovirus

Filovirus, termasuk virus Ebola (EBOV) dan virus Marburg (MARV), menyebabkan demam berdarah parah dengan tingkat kematian yang tinggi. Virus RNA indera negatif yang berselubung ini mempunyai virion berfilamen yang merupakan ciri dari famili Filoviridae. Penyakit virus Ebola (EVD) memiliki tingkat kematian rata-rata sekitar 50%, berkisar antara 25% hingga 90% pada wabah yang berbeda. Filovirus bereplikasi dalam berbagai jenis sel, dengan makrofag, sel dendritik, dan sel endotel sebagai target utamanya. Glikoprotein virus memediasi masuknya melalui pengikatan pada beberapa faktor perlekatan dan reseptor NPC1. Filovirus memusuhi respons imun bawaan melalui VP35, yang menghambat aktivasi faktor pengatur interferon 3 (IRF3), dan VP24, yang memblokir sinyal interferon dengan menghambat translokasi nuklir STAT1. Epidemi Ebola di Afrika Barat pada tahun 2014-2016, yang merupakan epidemi terbesar dalam sejarah dengan lebih dari 28.000 kasus, menyoroti kekurangan dalam infrastruktur kesehatan global dan pentingnya keterlibatan masyarakat, pelacakan kontak, dan praktik penguburan yang aman dalam pengendalian wabah. Pengembangan vaksin rVSV-ZEBOV, yang menunjukkan kemanjuran 100% dalam uji coba vaksinasi cincin, merupakan tonggak penting dalam kesiapan filovirus.

Flavivirus

Flavivirus adalah virus RNA positif yang ditularkan terutama oleh nyamuk dan kutu yang menyebabkan beban penyakit global yang signifikan. Virus dengue, dengan empat serotipe (DENV1–4), menginfeksi sekitar 390 juta orang setiap tahunnya, menyebabkan penyakit mulai dari penyakit demam ringan hingga demam berdarah dengue parah dan sindrom syok dengue. Peningkatan ketergantungan antibodi (ADE), dimana antibodi non-penetralisir yang sudah ada sebelumnya memfasilitasi masuknya virus ke dalam sel yang mengandung reseptor Fc, mempersulit patogenesis demam berdarah dan pengembangan vaksin. Virus Zika, yang muncul secara dramatis di Amerika pada tahun 2015-2016, menyebabkan penyakit ringan pada sebagian besar orang dewasa namun dapat menyebabkan sindrom Zika bawaan termasuk mikrosefali pada bayi yang lahir dari ibu yang terinfeksi dan sindrom Guillain-Barré pada orang dewasa. Virus demam kuning, meskipun vaksinnya sudah efektif sejak tahun 1937, terus menyebabkan wabah di Afrika dan Amerika Selatan karena kurangnya cakupan vaksinasi. Genom flavivirus mengkodekan tiga protein struktural (kapsid, premembran, envelope) dan tujuh protein nonstruktural, dengan NS5 berfungsi sebagai RNA polimerase yang bergantung pada RNA dan NS3 berfungsi sebagai protease dan helikase.

Virus Henipa

Henipavirus, antara lain virus Hendra (HeV) dan virus Nipah (NiV), merupakan paramyxovirus dengan patogenisitas tinggi yang muncul dari kelelawar buah (spesies Pteropus). Virus Nipah menyebabkan ensefalitis dan penyakit pernapasan dengan tingkat kematian sebesar 40–75%, dan wabah sering terjadi di Asia Selatan dan Tenggara, khususnya Bangladesh dan India, sering dikaitkan dengan konsumsi getah kurma yang terkontaminasi oleh kotoran kelelawar. Protein G virus berikatan dengan reseptor ephrin-B2 dan ephrin-B3, yang disimpan di seluruh spesies mamalia, berkontribusi terhadap beragam inang henipavirus. Penularan virus Nipah dari manusia ke manusia terjadi melalui kontak dekat, terutama di fasilitas kesehatan, sehingga memerlukan tindakan pengendalian infeksi yang ketat. Saat ini tidak ada vaksin atau terapi yang disetujui yang tersedia untuk henipavirus, meskipun vaksin eksperimental dan terapi antibodi monoklonal sedang dikembangkan.