Ikhtisar

Lipidomik adalah studi skala besar tentang lipid seluler, identitas, kelimpahan, distribusi spasial, dan peran biologisnya. Lipid memiliki struktur yang sangat beragam, mencakup asil lemak, gliserolipid, gliserofosfolipid, sphingolipid, sterol, dan prenol, masing-masing dengan banyak subspesies yang berbeda dalam panjang rantai, derajat ketidakjenuhan, dan komposisi gugus kepala. Keanekaragaman struktural ini diterjemahkan menjadi keragaman fungsional: lipid adalah bahan penyusun membran biologis, berfungsi sebagai molekul pemberi sinyal, dan berfungsi sebagai penyimpan energi. Lipidomik bertujuan untuk menangkap kompleksitas ini menggunakan alur kerja berbasis spektrometri massa yang dapat mendeteksi ratusan hingga ribuan spesies lipid berbeda dalam satu analisis.

Metode

Shotgun lipidomics memasukkan ekstrak lipid total langsung ke spektrometer massa melalui infus, menggunakan perbedaan massa antara kelas lipid dan pola fragmentasi karakteristik kelompok kepala untuk identifikasi. LC-MS lipidomics memadukan kromatografi cair, biasanya fase terbalik untuk pemisahan berdasarkan hidrofobisitas dan fase normal untuk pemisahan kelas, dengan spektrometri massa resolusi tinggi. Saluran pipa Analisis data menetapkan identitas lipid dengan mencocokkan massa, waktu retensi, dan spektrum MS/MS yang akurat dengan database seperti LipidMAPS. Alat perangkat lunak mengukur lipid menggunakan faktor respons spesifik kelas dan mengoreksi tumpang tindih isotop. Pencitraan spektrometri massa mengungkap distribusi spasial lipid dalam jaringan.

Aplikasi

Lipidomik sangat penting untuk memahami penyakit metabolik termasuk obesitas, diabetes, dan aterosklerosis. Ini mencirikan remodeling membran pada kanker, mengidentifikasi mediator lipid peradangan (eicosanoids), dan profil gangguan penyimpanan lipid. Bidang ini terintegrasi dengan prinsip-prinsip struktur dan klasifikasi lipid, analitik spektrometri massa, dan studi metabolisme metabolisme kolesterol dan oksidasi dan sintesis asam lemak.