BLAST 查找查询序列和数据库条目之间的局部相似性区域，以进行功能和进化推理。
结合位点预测可识别蛋白质上与配体、底物或其他大分子相互作用的区域。
计算蛋白质设计创建了新颖的蛋白质序列，可以折叠成具有特定功能的所需三维结构。
冷冻电子显微镜结构分析使用计算方法从显微图像重建三维大分子结构。
分子对接预测配体与蛋白质受体的优选方向和结合亲和力。
分子动力学模拟模拟原子和分子随时间的物理运动，以研究生物分子行为。
蛋白质结构比较对齐三维结构以识别进化关系和功能相似性。
蛋白质结构预测使用同源建模和深度学习，通过计算确定氨基酸序列的三维蛋白质结构。
RNA 结构预测通过计算确定 RNA 分子的核苷酸序列的二级和三级结构。
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