贝叶斯系统发育学：概率树推理
贝叶斯系统发育学使用马尔可夫链蒙特卡罗采样来估计树拓扑和参数的后验概率。
最大似然系统发育学
最大似然系统发育学在序列进化的概率模型下评估树拓扑，以找到最受支持的树。
分子钟：进化事件的约会
分子钟假说使用序列分歧率来估计物种形成和进化事件的时间。
系统发育树构建：重建进化历史
系统发育树构建使用序列数据来推断物种或基因之间的进化关系。
系统发育学：基因组规模系统发育学
系统基因组学使用全基因组数据以更高的分辨率和准确性重建进化关系。
贝叶斯系统发育学使用马尔可夫链蒙特卡罗采样来估计树拓扑和参数的后验概率。
最大似然系统发育学在序列进化的概率模型下评估树拓扑，以找到最受支持的树。
分子钟假说使用序列分歧率来估计物种形成和进化事件的时间。
系统发育树构建使用序列数据来推断物种或基因之间的进化关系。
系统基因组学使用全基因组数据以更高的分辨率和准确性重建进化关系。
