淀粉样蛋白、色素和矿物质污渍
淀粉样蛋白、内源性色素和矿物质沉积物的组织化学染色可识别组织切片中的这些物质，以进行特异性诊断。
碳水化合物和粘蛋白组织化学
碳水化合物和粘蛋白染色可检测组织切片中的糖原、糖蛋白、蛋白聚糖和粘蛋白，用于诊断组织化学。
结缔组织和肌肉染色
结缔组织对胶原蛋白、弹性纤维、肌肉和纤维蛋白进行不同颜色的染色，以评估纤维化、血管疾病和组织损伤。
H&E：配方、化学和故障排除
苏木精和伊红是标准组织染色剂；其化学成分和配方决定了核细节和细胞质对比度。
组织中微生物的染色
微生物的组织化学染色可以使福尔马林固定的组织切片中的细菌、真菌、分枝杆菌和寄生虫可视化。
