食品和饲料中转基因生物 (GMO) 的检测和定量对于监管合规性、标签执行和可追溯性要求至关重要。分析方法必须能够检测低含量的转基因材料，区分授权和未经授权的事件，并提供准确的量化。食品基质的复杂性、加工引起的 DNA 降解以及转基因事件的多样性带来了重大的分析挑战。监管机构的接受需要通过实验室间研究进行方法验证。

基于 DNA 的方法是最广泛使用的转基因生物检测方法。常规 PCR 靶向 GM 事件特有的特定 DNA 序列，并提供存在或不存在的定性结果。使用荧光探针的实时 PCR (qPCR) 通过根据标准曲线实时测量扩增情况，实现准确定量。数字 PCR (dPCR) 通过将样品分为数千个单独的反应，提供绝对定量，无需标准曲线。环介导等温扩增 (LAMP) 提供快速、可现场部署的检测，无需热循环设备。

基于蛋白质的方法检测 GM 事件表达的新蛋白质。酶联免疫吸附测定 (ELISA) 在实验室环境中使用转基因蛋白特异性抗体提供定量结果。侧流试纸条（免疫试纸条）可提供快速的现场定性筛查，广泛用于接收点和商品运输过程中的谷物检查。这些方法对于目标蛋白质完整的原始农产品最有效，但对于蛋白质变性或降解的高度加工食品，敏感性显着降低。

参考材料对于方法验证和定量至关重要。具有经过认证的 GM 浓度的认证标准物质 (CRM) 由欧盟标准物质和测量研究所 (IRMM) 等机构生产。这些用于校准分析方法、验证测量精度以及确定检测限 (LOD) 和定量限 (LOQ)。检测策略包括筛选常见遗传元件（例如 CaMV 35S 启动子、NOS 终止子）、针对元件之间连接处的构建体特异性检测以及针对整合位点处独特的植物-DNA 连接处的事件特异性检测。转基因生物检测对于遵守标签和监管 至关重要。方法通过确认转基因食品中是否存在特定基因修饰来支持安全评估。