旋毛虫是一种线虫寄生虫，通过食用生的或未煮熟的猪肉或含有包囊幼虫的野味肉而传播。摄入后，幼虫在小肠中释放，成熟为成虫，并产生新生幼虫，迁移到横纹肌组织。症状包括肌痛、眶周水肿、发烧和嗜酸性粒细胞增多。诊断基于血清学 (ELISA) 和肌肉活检。预防方法有赖于将猪肉内部温度烹调至 71°C，在 -15°C 下冷冻 3 周（尽管某些旋毛虫属抗冻性），以及适当的畜牧业。

弓形虫是一种原生动物寄生虫，以猫为最终宿主。人类通过摄入猫粪便（受污染的农产品、水）中的卵囊或未煮熟的肉类（特别是羊肉和猪肉）中的组织包囊而受到感染。大多数免疫功能正常的成人感染是无症状的，但妊娠期间原发性感染引起的先天性弓形虫病可导致严重的胎儿损伤，包括脑积水、脉络膜视网膜炎和智力障碍。预防措施包括彻底煮熟肉类、清洗农产品、园艺时戴手套以及怀孕期间避免猫砂。没有适用于人类的疫苗。

小隐孢子虫是一种原生动物寄生虫，可引起隐孢子虫病，其特征是水样腹泻和腹部绞痛。它通过受污染的水（娱乐用水和饮用水）以及用受污染的水灌溉的农产品传播。这种寄生虫对氯消毒具有很强的抵抗力，使其成为水传播疾病爆发的常见原因。粪便检测采用改良的抗酸染色或免疫荧光，分子分型有助于追踪来源。臭氧和紫外线照射对水处理有效，感染者应避免游泳。

单纯异尖线虫是一种线虫，存在于生的或未煮熟的海鱼（鲱鱼、鲭鱼、鲑鱼、鳕鱼、鱿鱼）中。摄入活的幼虫会引起异尖线虫病，幼虫会穿透胃或肠粘膜，引起严重的上腹疼痛、恶心和呕吐。即使在摄入死亡幼虫后，也会发生对异尖线虫过敏原的过敏反应（荨麻疹、过敏反应）。预防措施包括将鱼在 -20°C 下冷冻至少 24 小时（根据欧盟和 FDA 对寿司等生鱼菜肴的规定），或烹饪至 >60°C。对鱼片进行目视检查（烛光检查）可发现部分（但不是全部）幼虫。寄生虫是食源性感染的一种形式，其潜伏期比大多数细菌感染更长。与病毒一样，它们不会在食物中繁殖。充分烹饪和冷冻是有效的控制措施。