Southern 印迹是一种实验室技术，用于检测复杂基因组样本中的特定 DNA 序列。这种方法以其发明者埃德温·萨瑟恩 (Edwin Southern) 的名字命名，它允许科学家从包含数百万单词的库中挑选出遗传信息的单个“句子”。它是验证基因插入、识别基因突变的黄金标准，也是法医学中“DNA 指纹识别”的最初基础。

Southern 印迹法的工作原理

因为基因组非常庞大，所以你不能仅仅在凝胶上运行它并期望看到单个基因；而是需要在凝胶上运行它。它看起来就像是连续的涂抹。 Southern blotting 使用精确切割和“尼龙搭扣样”探针来寻找目标。

1. 消化

提取的 DNA 用限制性酶处理。这些分子剪刀仅在特定序列处切割 DNA，将长基因组链切成数千个不同长度的较小片段。

2. 电泳

使用 [琼脂糖凝胶](/guides/agarose-gel- electrophoresis.html) 按大小分离 DNA 片段。小碎片快速穿过凝胶，而大碎片则停留在顶部附近。为了使 DNA 对下一步具有“粘性”，用碱性溶液处理凝胶，使双链 DNA 变性为单链。

3. 转账

DNA 从脆弱的凝胶转移到坚固的尼龙或硝酸纤维素膜上。这通常是通过毛细作用完成的：一堆干纸巾将 SSC（柠檬酸钠盐水）缓冲液向上吸过凝胶和膜。当液体移动时，它将 DNA 带出凝胶并将其永久捕获在膜的表面上。

4. 杂交和检测

膜与标记的 DNA 探针一起孵育，探针是一段短的单链 DNA，是目标序列的精确镜像。探针“狩猎”穿过膜，直到找到匹配的并快速附着在膜上（杂交）。洗掉多余的探针后，将膜暴露在 X 射线胶片或数字扫描仪下，以显示目标基因的确切位置和大小。