氨基酸是作为蛋白质构建单元的有机化合物。每个氨基酸含有一个氨基、一个羧基、一个氢原子和一个独特的侧链（R基团），它们连接在中心α-碳上。二十种标准氨基酸由遗传密码编码。

按侧链性质分类

非极性疏水氨基酸

这些氨基酸的侧链是疏水的，倾向于聚集在蛋白质内部。包括甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、蛋氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸和色氨酸。脯氨酸很独特，因为其侧链与氨基形成环状结构。

极性不带电氨基酸

这些氨基酸的侧链可以和水形成氢键。包括丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺。半胱氨酸可以形成稳定蛋白质结构的二硫键。

带正电（碱性）氨基酸

这些氨基酸在生理pH下侧链带正电。包括赖氨酸、精氨酸和组氨酸。组氨酸的pKa接近生理pH，使其能够在酶活性位点充当质子供体或受体。

带负电（酸性）氨基酸

这些氨基酸在生理pH下侧链带负电。包括天冬氨酸和谷氨酸。它们的羧基通常参与盐桥和金属结合。

特殊性质

等电点

每种氨基酸都有其特征等电点（pI）——即不携带净电荷时的pH值。当pH值低于pI时，氨基酸带正电；高于pI时，带负电。

光学活性

除甘氨酸外，所有标准氨基酸都是手性的，存在L型和D型对映体。只有L型氨基酸被核糖体整合到蛋白质中。