逆转录PCR(RT-PCR)是一种用于检测和扩增RNA的技术。它结合了两个步骤:将RNA逆转录为互补DNA(cDNA),然后对cDNA进行PCR扩增。这使科学家能够研究基因表达并检测RNA病毒。
RT-PCR的工作原理
- RNA提取
从样品中提取总RNA,并用DNase处理以去除任何污染的基因组DNA。在继续之前检查RNA质量和浓度。
- 逆转录
将RNA与逆转录酶、随机引物或oligo-dT引物以及核苷酸混合。逆转录酶以RNA为模板合成互补的DNA链。然后通过RNase H降解RNA模板,留下单链cDNA。
- PCR扩增
然后使用基因特异性引物将cDNA作为标准PCR的模板。PCR扩增cDNA,产生足够的DNA以在凝胶上可视化或通过qPCR定量。
- 检测
通过琼脂糖凝胶电泳分析扩增的PCR产物。在预期大小处出现条带确认原始样品中存在目标RNA。
- 应用
RT-PCR广泛用于测量基因表达水平、检测RNA病毒(如HIV和SARS-CoV-2)、验证RNA测序数据和分析选择性剪接。当与qPCR结合时,成为RT-qPCR,允许实时定量RNA。