La espectrometría de masas en tándem (MS/MS) implica dos o más etapas de análisis de masas, lo que permite la selección de un ion precursor y el análisis de sus iones fragmento. Esto proporciona información estructural detallada y permite una cuantificación altamente específica en matrices complejas.
Los experimentos de MS/MS siguen la secuencia de selección del ion precursor, fragmentación y análisis de masas de los iones fragmento. Los iones precursores de un valor de m/z seleccionado se aíslan en el primer analizador de masas. La fragmentación se induce mediante disociación por colisión con moléculas de gas inerte, disociación por captura/transferencia de electrones o activación por fotones. Los iones fragmento resultantes se analizan en el segundo analizador de masas.
Los instrumentos de tándem en el espacio separan las etapas de análisis de masas en diferentes regiones físicas. Los instrumentos de triple cuadrupolo (QqQ) utilizan dos filtros de masas cuadrupolares separados por una celda de colisión y son los caballos de batalla de la LC-MS/MS cuantitativa. Los instrumentos de cuadrupolo-tiempo de vuelo (Q-TOF) combinan un cuadrupolo para la selección de precursores con un analizador TOF de alta resolución. Los instrumentos de tándem en el tiempo realizan múltiples etapas en el mismo espacio físico, como en los instrumentos de trampa de iones.
Los modos de escaneo comunes incluyen el escaneo de iones producto, donde el precursor es fijo y se escanean los fragmentos; el escaneo de iones precursores, donde el fragmento es fijo y se escanean los precursores; y el escaneo de pérdida neutra, donde ambos analizadores escanean con un desplazamiento de masa fijo. El monitoreo de reacciones múltiples (MRM) fija tanto el precursor como el fragmento para máxima sensibilidad y especificidad en la cuantificación.
MS/MS es esencial para proteómica, metabolómica, toxicología forense, diagnóstico clínico y análisis ambiental. Su capacidad para resolver compuestos isobáricos y proporcionar confirmación estructural la convierte en el estándar de oro para el bioanálisis cuantitativo.