Northern 印迹是一种用于检测和定量生物样品中特定 RNA 分子的实验室技术。 Western blot 着眼于蛋白质,Southern blot 着眼于 DNA,而 Northern blot 则告诉科学家哪些基因实际上在特定时间在细胞中“开启”(表达)。通过测量信使 RNA (mRNA) 的数量,研究人员可以确定疾病、药物或环境变化是否导致细胞增加或停止特定指令的产生。
Northern 印迹的工作原理
众所周知,RNA 非常脆弱,很容易被称为 RNase 的酶降解,这种酶无处不在,甚至在您的指尖上。因此,该过程需要极其小心和“清洁”的条件。
1.RNA分离
从细胞中提取总 RNA,并使用凝胶电泳按大小进行分离。由于 RNA 是单链,它往往会折叠成复杂的形状;为了防止这种情况发生,凝胶中添加了一种“变性”剂(如甲醛),以保持 RNA 分子呈线性,以便它们严格按照其长度移动。
- 转账
就像在蛋白质印迹中一样,分离的 RNA 链从脆弱的凝胶转移到坚固的尼龙或硝酸纤维素膜上。这通常是通过毛细管作用完成的,即一堆纸巾“芯吸”SSC(柠檬酸钠盐水)缓冲液穿过凝胶和膜,将 RNA 一起拉动并将其捕获在膜的表面上。
- 杂交
将膜暴露于探针——与目标序列互补的短单链 DNA 或 RNA 片段。该探针用放射性原子或荧光染料“标记”。探针扫描膜并仅与其匹配的 RNA 伴侣结合(杂交),忽略所有其他 RNA“噪音”。
4、检测
洗掉未结合的探针后,将膜放在 X 射线胶片上或用数字成像仪扫描。标记的探针会产生暗带或发光线。带的厚度和强度告诉科学家原始样品中存在多少特定 mRNA。