Sequenzausrichtung: Paarweiser Vergleich biologischer Sequenzen
Beim Sequenz-Alignment werden DNA-, RNA- oder Proteinsequenzen angeordnet, um Bereiche mit Ähnlichkeit und evolutionären Beziehungen zu identifizieren.
Bioinformatik Sequenzassemblierung: Rekonstruktion von DNA aus Fragmenten
Sequenzassemblierungsalgorithmen führen überlappende DNA-Fragmente zu zusammenhängenden Sequenzen für die Genom- und Transkriptomrekonstruktion zusammen.
Bioinformatik Sequenzdatenbanksuche mit BLAST
BLAST findet Bereiche lokaler Ähnlichkeit zwischen Abfragesequenzen und Datenbankeinträgen für funktionale und evolutionäre Schlussfolgerungen.
Bioinformatik Alternative Spleißanalyse
Die alternative Spleißanalyse identifiziert und quantifiziert verschiedene mRNA-Isoformen, die aus demselben Gen produziert werden.
Bioinformatik Differentialausdrucksanalyse
Die differenzielle Expressionsanalyse identifiziert Gene mit statistisch signifikanten Veränderungen in der Expression zwischen Bedingungen.
Bioinformatik Microarray-Datenanalyse
Die Microarray-Datenanalyse verarbeitet Sondenintensitäten, um die Genexpression über Tausende von Genen gleichzeitig zu messen.
Bioinformatik RNA-Seq-Analyse: Quantifizierung der Genexpression
RNA-seq nutzt Hochdurchsatzsequenzierung, um die Transkripthäufigkeit zu quantifizieren und neue RNA-Arten zu entdecken.
Bioinformatik Einzelzell-RNA-Sequenzierung
Einzelzell-RNA-Seq-Profile der Genexpression auf individueller Zellebene, wodurch zelluläre Heterogenität sichtbar wird.
Bioinformatik Kleine RNA-Sequenzierung und -Analyse
Die Sequenzierung kleiner RNA erfasst miRNAs, siRNAs und piRNAs, die die Genexpression posttranskriptionell regulieren.
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