Kleine RNA-Sequenzierung und -Analyse
Die Sequenzierung kleiner RNA erfasst miRNAs, siRNAs und piRNAs, die die Genexpression posttranskriptionell regulieren.
TranskriptomikTranskriptomassemblierung: Rekonstruktion von RNA-Sequenzen
Die Transkriptomassemblierung rekonstruiert Transkriptsequenzen voller Länge aus RNA-seq-Reads ohne Referenzgenom.
TranskriptomikBiologische Datenbanken: Ein Umfassender Überblick
Biologische Datenbanken speichern, organisieren und ermöglichen den Zugriff auf große Mengen molekularer Daten, darunter Sequenzen, Strukturen und funktionelle Annotationen.
DatenbankenEnzymdatenbanken: BRENDA und ExplorEnz
Enzymdatenbanken bieten umfassende Informationen über Enzymkinetik, Substrate, Inhibitoren und biochemische Reaktionen.
DatenbankenGenexpressionsdatenbanken: GEO und ArrayExpress
Genexpressionsdatenbanken archivieren und verteilen Transkriptomikdaten aus Microarray- und Sequenzierungsexperimenten zur öffentlichen Wiederverwendung.
DatenbankenNCBI-Datenbanken: GenBank, RefSeq und SRA
Das Nationale Zentrum für Biotechnologieinformation beherbergt wesentliche Datenbanken für Nukleotidsequenzen, Genome und Sequenzierungslesearchive.
DatenbankenPfad- und Ontologiedatenbanken: KEGG, GO und Reactome
Pfad- und Ontologiedatenbanken organisieren systematisch biologisches Wissen über molekulare Funktionen, zelluläre Prozesse und Stoffwechselwege.
DatenbankenUniProt und Proteinsequenzdatenbanken
UniProt bietet eine umfassende Ressource für Proteinsequenzen und funktionelle Annotationen, die Daten aus zahlreichen Quellen integriert.
DatenbankenVariationsdatenbanken: dbSNP, ClinVar und COSMIC
Variationsdatenbanken katalogisieren genetische Varianten in Populationen und ihre Assoziationen mit Krankheiten, Arzneimittelantwort und Phänotypen.
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