Proteómica cuantitativa: medición de la abundancia de proteínas
La proteómica cuantitativa utiliza estrategias de etiquetado y métodos sin etiquetas para medir la abundancia relativa o absoluta de proteínas.
BiologíaProteómica dirigida: métodos SRM y MRM
La proteómica dirigida utiliza el monitoreo de reacciones seleccionadas para cuantificar proteínas específicas con alta sensibilidad y reproducibilidad.
BiologíaProteómica de arriba hacia abajo: análisis de proteínas intactas
La proteómica de arriba hacia abajo analiza proteínas intactas sin digestión, preservando información sobre proteoformas y modificaciones postraduccionales.
BiologíaModelos ocultos de Markov en análisis de secuencia
Los modelos ocultos de Markov son marcos probabilísticos para modelar patrones de secuencia en la búsqueda, alineación y clasificación de familias de proteínas de genes.
BiologíaAnálisis K-mer: composición y frecuencia de la secuencia
El análisis de K-mer cuenta subcadenas cortas de longitud k en secuencias para la caracterización del genoma, la corrección de errores y la agrupación metagenómica.
BiologíaDescubrimiento de motivos: encontrar patrones regulatorios en secuencias
El descubrimiento de motivos identifica patrones de secuencia cortos y conservados que representan sitios de unión o elementos funcionales.
BiologíaAlineación de secuencias múltiples: comparación de tres o más secuencias
El alineamiento de secuencias múltiples extiende el alineamiento por pares para comparar múltiples secuencias homólogas para análisis filogenéticos y funcionales.
BiologíaDiseño de cebadores para PCR y secuenciación.
El diseño del cebador crea oligonucleótidos cortos con termodinámica y especificidad óptimas para reacciones de secuenciación y amplificación por PCR.
BiologíaAnálisis de promotores: identificación de regiones regulatorias
El análisis del promotor identifica sitios de inicio de la transcripción y elementos reguladores que controlan la expresión génica.
BiologíaAlineación de secuencias: comparación por pares de secuencias biológicas
El alineamiento de secuencias organiza secuencias de ADN, ARN o proteínas para identificar regiones de similitud y relaciones evolutivas.
BiologíaEnsamblaje de secuencias: reconstrucción de ADN a partir de fragmentos
Los algoritmos de ensamblaje de secuencias fusionan fragmentos de ADN superpuestos en secuencias contiguas para la reconstrucción del genoma y el transcriptoma.
BiologíaBúsqueda de bases de datos de secuencias con BLAST
BLAST encuentra regiones de similitud local entre secuencias de consulta y entradas de bases de datos para inferencia funcional y evolutiva.
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