Les tests de sensibilité aux antimicrobiens déterminent l’efficacité des agents antimicrobiens contre les microorganismes. Au-delà de la diffusion standard sur disque et de la dilution en milieu liquide, les méthodes avancées fournissent des informations mécanistiques sur la résistance et permettent une thérapie ciblée.

Les systèmes automatisés comme VITEK et BD Phoenix utilisent la microdilution en milieu liquide miniaturisée dans des cartes multipuits avec détection colorimétrique ou turbidimétrique. Les résultats sont disponibles en 4 à 12 heures avec des valeurs de CMI pour un panel complet d’antimicrobiens. Ces systèmes intègrent des règles expertes pour la détection des mécanismes de résistance.

L’Etest utilise une bandelette plastique avec un gradient antimicrobien prédéfini. Il combine la commodité de la diffusion sur disque avec la CMI quantitative des méthodes de dilution. L’intersection de l’ellipse d’inhibition avec la bandelette révèle la CMI. L’Etest est utile pour les organismes exigeants et lorsque des valeurs de CMI individuelles pour des médicaments spécifiques sont nécessaires.

La détection des carbapénémases est devenue essentielle pour le contrôle des infections. La méthode modifiée d’inactivation des carbapénèmes détecte la production de carbapénémase chez les Enterobacteriaceae, Pseudomonas et Acinetobacter. Le test Carba NP détecte l’hydrolyse des carbapénèmes par colorimétrie. Les tests moléculaires incluant la PCR et les micropuces détectent les gènes de carbapénémase incluant les variants KPC, NDM, VIM, IMP et OXA.

La confirmation des bêta-lactamases à spectre étendu utilise l’inhibition synergique par l’acide clavulanique. Les tests de disques combinés avec et sans inhibiteur confirment la production de BLSE. La détection des bêta-lactamases AmpC utilise l’inhibition par l’acide boronique ou la cloxacilline.

La résistance à la méthicilline chez les staphylocoques est détectée par diffusion sur disque de céfoxitine ou agglutination au latex PBP2a. La résistance à la vancomycine chez les entérocoques est confirmée par PCR vanA/vanB. Les phénotypes de résistance aux macrolides-lincosamides-streptogramines sont différenciés par le test de zone D.

Les méthodes génotypiques incluant le séquençage du génome entier fournissent un profilage complet des gènes de résistance. Le séquençage de nouvelle génération détecte les déterminants de résistance connus et nouveaux, les marqueurs de typage et les gènes de virulence directement à partir d’échantillons cliniques ou d’isolats.

Les critères d’interprétation suivent les directives CLSI ou EUCAST. Le choix des points de coupure affecte la catégorisation clinique. Les valeurs seuils épidémiologiques distinguent les populations sauvages des non sauvages indépendamment du résultat clinique.