Phylogénétique bayésienne : inférence d'arbres probabilistes
La phylogénétique bayésienne utilise l'échantillonnage de Monte Carlo par chaîne de Markov pour estimer les probabilités a posteriori des topologies et des paramètres des arbres.
Phylogénétique à vraisemblance maximale
La phylogénétique du maximum de vraisemblance évalue les topologies des arbres selon des modèles probabilistes d'évolution des séquences pour trouver l'arbre le mieux pris en charge.
L'horloge moléculaire : datation des événements évolutifs
L'hypothèse de l'horloge moléculaire utilise le taux de divergence des séquences pour estimer le moment de la spéciation et des événements évolutifs.
Construction d'arbres phylogénétiques : reconstruire l'histoire évolutive
La construction d'arbres phylogénétiques utilise des données de séquence pour déduire des relations évolutives entre les espèces ou les gènes.
Phylogénomique : phylogénétique à l'échelle du génome
La phylogénomique utilise des données pangénomiques pour reconstruire les relations évolutives avec une plus grande résolution et précision.