La mycologie médicale traite des infections fongiques chez l’humain. Les levures sont des champignons unicellulaires qui se reproduisent par bourgeonnement. Les levures les plus cliniquement significatives appartiennent aux genres Candida et Cryptococcus. L’incidence des infections invasives à levures a considérablement augmenté avec la population croissante de patients immunodéprimés.
Les espèces de Candida sont des commensaux du tractus gastro-intestinal, de la peau et des muqueuses. C. albicans est l’espèce pathogène la plus courante, mais les espèces non albicans incluant C. glabrata, C. parapsilosis, C. tropicalis et C. krusei sont de plus en plus importantes. La candidose va des infections mucocutanées superficielles (muguet buccal, candidose vulvovaginale) à la candidémie invasive avec dissémination aux organes profonds. Les facteurs prédisposants incluent l’utilisation d’antibiotiques, l’immunosuppression, les cathéters à demeure et le diabète.
Le diagnostic en laboratoire de la candidose inclut la microscopie directe des échantillons cliniques montrant des levures en bourgeonnement avec des pseudohyphes, la culture sur gélose Sabouraud dextrose et l’identification par test du tube germinatif (C. albicans est positif), gélose chromogène ou MALDI-TOF MS. Les tests de sensibilité aux antifongiques par microdilution en milieu liquide guident le choix du traitement.
Cryptococcus neoformans et C. gattii causent la cryptococcose. C. neoformans est un pathogène opportuniste majeur chez les patients VIH/SIDA, provoquant une méningoencéphalite. Le champignon possède une capsule polysaccharidique qui est son principal facteur de virulence. Le diagnostic utilise la coloration à l’encre de Chine des échantillons de LCR pour visualiser les cellules de levure encapsulées, la détection d’antigène par agglutination au latex ou test à flux latéral, et la culture. Le traitement implique l’amphotéricine B avec la flucytosine pour la thérapie d’induction suivie de la fluconazole en entretien.
La résistance aux antifongiques est une préoccupation croissante. La résistance aux azolés chez les espèces de Candida, particulièrement C. glabrata et C. auris, limite les options thérapeutiques. La résistance aux échinocandines émerge. Les tests de sensibilité sont essentiels pour guider la thérapie dans les infections invasives.
