Analyse des promoteurs : identification des régions réglementaires
L'analyse du promoteur identifie les sites d'initiation de la transcription et les éléments régulateurs qui contrôlent l'expression des gènes.
Analyse de séquencesAlignement de séquence : comparaison par paires de séquences biologiques
L'alignement des séquences organise les séquences d'ADN, d'ARN ou de protéines pour identifier les régions de similarité et les relations évolutives.
Analyse de séquencesAssemblage de séquence : reconstruction de l'ADN à partir de fragments
Les algorithmes d'assemblage de séquences fusionnent des fragments d'ADN qui se chevauchent en séquences contiguës pour la reconstruction du génome et du transcriptome.
Analyse de séquencesRecherche dans la base de données de séquences avec BLAST
BLAST trouve des régions de similarité locale entre les séquences de requêtes et les entrées de base de données pour une inférence fonctionnelle et évolutive.
Analyse de séquencesAnalyse d'épissage alternative
L'analyse d'épissage alternatif identifie et quantifie différentes isoformes d'ARNm produites à partir du même gène.
TranscriptomiqueAnalyse d'expression différentielle
L'analyse de l'expression différentielle identifie les gènes présentant des changements d'expression statistiquement significatifs entre les conditions.
TranscriptomiqueAnalyse des données de puces à ADN
L'analyse des données des puces à ADN traite les intensités des sondes pour mesurer simultanément l'expression des gènes sur des milliers de gènes.
TranscriptomiqueAnalyse ARN-Seq : quantification de l'expression des gènes
RNA-seq utilise le séquençage à haut débit pour quantifier l’abondance des transcrits et découvrir de nouvelles espèces d’ARN.
TranscriptomiqueSéquençage d'ARN unicellulaire
L'ARN-seq unicellulaire profile l'expression des gènes au niveau de la cellule individuelle, révélant l'hétérogénéité cellulaire.
Transcriptomique