Bioinformatique protéomique : analyse des données sur les protéines
La bioinformatique protéomique développe des méthodes informatiques pour identifier, quantifier et caractériser les protéines à partir de données de spectrométrie de masse.
ProtéomiqueProtéomique quantitative : mesurer l'abondance des protéines
La protéomique quantitative utilise des stratégies de marquage et des méthodes sans marquage pour mesurer les abondances relatives ou absolues des protéines.
ProtéomiqueProtéomique ciblée : méthodes SRM et MRM
La protéomique ciblée utilise la surveillance de réactions sélectionnées pour quantifier des protéines spécifiques avec une sensibilité et une reproductibilité élevées.
ProtéomiqueProtéomique descendante : analyse des protéines intactes
La protéomique descendante analyse les protéines intactes sans digestion, préservant ainsi les informations sur les protéoformes et les modifications post-traductionnelles.
ProtéomiqueModèles de Markov cachés dans l'analyse de séquence
Les modèles de Markov cachés sont des cadres probabilistes permettant de modéliser des modèles de séquences dans la recherche de gènes, l'alignement et la classification des familles de protéines.
Analyse de séquencesAnalyse K-mer : composition et fréquence des séquences
L'analyse K-mer compte les sous-chaînes courtes de longueur k dans les séquences pour la caractérisation du génome, la correction d'erreurs et le regroupement métagénomique.
Analyse de séquencesDécouverte de motifs : trouver des modèles de régulation dans des séquences
La découverte de motifs identifie des modèles de séquences courts et conservés qui représentent des sites de liaison ou des éléments fonctionnels.
Analyse de séquencesAlignement de plusieurs séquences : comparaison de trois séquences ou plus
L'alignement de séquences multiples étend l'alignement par paires pour comparer plusieurs séquences homologues à des fins d'analyse phylogénétique et fonctionnelle.
Analyse de séquencesConception d'amorces pour la PCR et le séquençage
La conception d’amorces crée des oligonucléotides courts avec une thermodynamique et une spécificité optimales pour les réactions d’amplification et de séquençage PCR.
Analyse de séquences