La réception du spécimen, l’examen macroscopique et la dissection constituent la phase pré-analytique de la pathologie chirurgicale. Chaque étape impacte directement le diagnostic final et doit être exécutée avec précision selon des protocoles standardisés.
Réception du Spécimen
Chaque spécimen arrive avec une demande (formulaire papier ou électronique) précisant les données du patient, le clinicien référent, le site anatomique, le type de spécimen (biopsie, résection, excision), les antécédents cliniques, l’hypothèse diagnostique et toute demande de test spécial (IHC, congélation, cytogénétique, culture microbiologique).
L’étape de réception vérifie que la demande et le contenant correspondent (évitant les erreurs d’identité), que le spécimen est correctement fixé (biopsies immergées dans un volume adéquat de formol, spécimens non fixés pour culture ou congélation), que le spécimen n’est pas desséché (couvert de formol ou de solution saline dans un contenant scellé) et que la demande est complète (site anatomique, antécédents cliniques, demandes de test mentionnées). Les spécimens urgents (biopsies peropératoires pour coupe congelée, spécimens prioritaires) sont identifiés et acheminés immédiatement. Si des problèmes sont identifiés — absence de spécimen, inadéquation demande-contenant, spécimen sans formol — le laboratoire contacte le service préleveur avant de continuer.
Examen Macroscopique
L’examen macroscopique (description macroscopique) est la documentation des caractéristiques visibles à l’œil nu du spécimen. Le pathologiste ou le pathologiste adjoint (PA) inspecte le spécimen avec un éclairage adéquat et documente : le type de spécimen (biopsie, pièce de résection, rate, vésicule biliaire, côlon, etc.), la taille (mesurée dans trois dimensions : longueur × largeur × épaisseur en centimètres — pour les pièces de résection, également la dimension des marges), le poids (pour les spécimens standardisés : rate, rein, thyroïde), la couleur (brun, rouge, gris, noir, jaune, blanc), la consistance (ferme, mou, nodulaire, kystique, calcifié), les caractéristiques de surface (lisse, bosselée, exophytique, ulcérée) et la présence de lésions (taille, nombre, forme, marge, couleur, nécrose, hémorragie, calcification, contenu — solide vs kystique).
La description macroscopique est dictée ou entrée dans le système LIS (Laboratory Information System) sous forme de texte libre ou structurée dans des modèles standardisés. Des images du spécimen intact et en coupe (photographie macroscopique) sont prises pour les dossiers, l’enseignement et, de plus en plus, l’extraction de données par IA.
Dissection et Mise en Cassette
La dissection (grossing) est le processus de découpe du spécimen pour en sélectionner des sections représentatives pour l’examen microscopique. Le tissu est tranché en fines tranches de ≤5 mm d’épaisseur (le formol pénètre de 0,5 à 1 mm par heure ; des tranches plus épaisses empêchent une fixation adéquate), et des cassettes sont étiquetées avec un identifiant unique. La sélection des sections à mettre en cassette suit des directives standardisées par type d’organe et pathologie suspectée, visant à représenter la lésion, la jonction tumeur-tissu normal, les marges chirurgicales et le tissu normal adjacent. La cartographie des cassettes — un diagramme ou une photographie annotée montrant où chaque cassette a été prélevée — assure la traçabilité de l’échantillon.
Dissection de la marge — les marges chirurgicales sont encrées avec des couleurs différentes (encre noire, bleue, jaune, rouge) avant la dissection, de sorte que la relation microscopique entre la tumeur et la marge soit visible. Chaque couleur est documentée dans le rapport macroscopique. L’encre est appliquée au pinceau, trempée ou pulvérisée, puis séchée (généralement avec du fixateur de Bouin, de l’acétone ou un courant d’air) avant la coupe.
Spécimens particuliers : les agrafes et clips doivent être retirés avant la coupe (sinon les lames du microtome sont émoussées et des artéfacts métalliques apparaissent). Le tissu adipeux (sein, omentum, mésentère flotte dans le formol) est pesé, puis fixé séparément pour empêcher la flottaison. Les biopsies de moelle osseuse — le spécimen osseux est fixé, décalcifié et coupé ; l’empreinte est réalisée avant fixation (pour un diagnostic cytologique rapide). Les petites biopsies (biopsies à l’aiguille, biopsies endoscopiques) sont placées dans des cassettes de petite taille avec des éponges ou des papiers filtres pour éviter la perte.
Contrôle Qualité
Les audits aléatoires des transcriptions macroscopiques et des photographies vérifient l’exhaustivité. Les protocoles d’échantillonnage standardisés réduisent la variabilité entre les pathologistes et entre les laboratoires. Tous les écarts par rapport aux directives d’échantillonnage pour raison clinique doivent être documentés. La relecture du rapport macroscopique avant et après la coupe garantit que la documentation correspond à ce qui a été vu et prélevé. Les erreurs — cassette perdue, marge non identifiée — sont immédiatement rapportées et corrigées.
